Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms