Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms