Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms