Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms