Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Pate4Q09098 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms