Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms