Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf9Q07105 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms