Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smarcad1Q04692 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms