Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms