Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms