Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms