Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GscQ02591 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GscQ02591 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GscQ02591 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GscQ02591 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GscQ02591 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GscQ02591 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms