Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnb1Q02248 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnb1Q02248 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms