Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grin2bQ01097 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms