Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Itga4Q00651 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms