Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms