Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Scn1bP97952 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Scn1bP97952 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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