Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irx3P81067 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx3P81067 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx3P81067 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms