Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Hoxd13P70217 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms