Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vamp2P63044 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms