Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms