Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Ube2d3P61079 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms