Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcbp1P60335 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcbp1P60335 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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