Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms