Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms