Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GferP56213 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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