Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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