Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rad23bP54728 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rad23bP54728 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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