Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PctpP53808 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PctpP53808 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms