Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms