Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SftpdP50404 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SftpdP50404 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms