Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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LtbrP50284 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbrP50284 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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