Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms