Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms