Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax7P47239 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax7P47239 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms