Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx1-2P42580 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms