Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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VhlP40338 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VhlP40338 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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