Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprkP35822 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprkP35822 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms