Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms