Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Hoxc11P31313 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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