Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RxraP28700 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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