Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgfb2P27090 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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