Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkchP23298 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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