Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PparaP23204 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PparaP23204 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PparaP23204 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PparaP23204 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PparaP23204 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PparaP23204 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PparaP23204 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PparaP23204 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PparaP23204 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PparaP23204 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PparaP23204 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PparaP23204 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PparaP23204 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PparaP23204 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PparaP23204 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PparaP23204 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PparaP23204 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PparaP23204 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PparaP23204 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PparaP23204 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PparaP23204 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PparaP23204 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms