Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
RarbP22605 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RarbP22605 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RarbP22605 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RarbP22605 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RarbP22605 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms