Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P20040 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P20040 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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