Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NefhP19246 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NefhP19246 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NefhP19246 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NefhP19246 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms