Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Hoxb1P17919 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Hoxb1P17919 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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