Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PcnaP17918 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PcnaP17918 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms