Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sptan1P16546 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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